胃肠肿瘤生物样本库信息共享平台数据元目录分类框架体系的构建

doi:10.3877/cma.j.issn.1674-0793.2022.01.006

中华普通外科学文献(电子版) ›› 2022, Vol. 16 ›› Issue (01) : 32 -36. doi: 10.3877/cma.j.issn.1674-0793.2022.01.006

论著

胃肠肿瘤生物样本库信息共享平台数据元目录分类框架体系的构建

薛曼婕¹, 魏波², 陈斯乐³, 谢朗⁴, 邹妞¹, 卫洪波², 韩晓燕¹^,^†(

)

^1. 510630　广州，中山大学附属第三医院临床样本资源库
^2. 510630　广州，中山大学附属第三医院胃肠外科
^3. 510080　广州，中山大学附属第一医院胃肠外科
^4. 510280　广州，南方医科大学珠江医院普通外科

收稿日期:2021-05-08 出版日期:2022-02-01
通信作者: 韩晓燕
基金资助:
广东省科技计划项目(2019B030316011)

Construction of a classification framework of data element dictionary of gastrointestinal tumor biobank

Manjie Xue¹, Bo Wei², Sile Chen³, Lang Xie⁴, Niu Zou¹, Hongbo Wei², Xiaoyan Han¹^,^†()

^1. Department of Biobank of Clinical Resources, the Third Affiliated Hospital of Sun Yat-sen University, Guangzhou 510630, China; 3Department of Gastrointestinal Surgery, the First Affiliated Hospital of Sun Yat-sen University, Guangzhou 510080, China
^2. Department of Gastrointestinal Surgery, the Third Affiliated Hospital of Sun Yat-sen University, Guangzhou 510630, China
^3. Department of Gastrointestinal Surgery, the First Affiliated Hospital of Sun Yat-sen University, Guangzhou 510080, China
^4. Department of General Surgery, Zhujiang Hospital of Southern Medical University, Guangzhou 510280, China

Received:2021-05-08 Published:2022-02-01
Corresponding author: Xiaoyan Han

全文 ( ) 下载PDF ( ) 导出引用

引用本文：

薛曼婕, 魏波, 陈斯乐, 谢朗, 邹妞, 卫洪波, 韩晓燕. 胃肠肿瘤生物样本库信息共享平台数据元目录分类框架体系的构建[J]. 中华普通外科学文献(电子版), 2022, 16(01): 32-36.

Manjie Xue, Bo Wei, Sile Chen, Lang Xie, Niu Zou, Hongbo Wei, Xiaoyan Han. Construction of a classification framework of data element dictionary of gastrointestinal tumor biobank[J]. Chinese Archives of General Surgery(Electronic Edition), 2022, 16(01): 32-36.

目的

构建胃肠肿瘤生物样本库信息共享平台数据元目录分类框架体系。

方法

通过文献检索和专家咨询，初步拟定胃肠肿瘤生物样本库信息共享平台数据元目录，采用德尔菲法，以电子邮件发送和回收问卷调查表的方式，对24名专家进行2轮问卷调查。

结果

2轮专家咨询的积极系数分别为100.00%和91.67%，权威系数分别为0.825和0.832，协调系数分别为0.434和0.467（均P<0.001），构建的胃肠肿瘤生物样本库信息共享平台数据元目录分类框架体系包括一级条目4个、二级条目11个、三级条目49个。

结论

通过德尔菲法构建的胃肠肿瘤生物样本库信息共享平台数据元目录分类框架体系，具有较好的科学性和可靠性，可促进网络共享平台的建立，实现胃肠肿瘤生物样本信息的检索与共享。

关键词: 德尔菲法, 生物样本库, 共享平台, 数据元目录

Objective

To construct a classification framework of data element dictionary of gastrointestinal tumor biobank information sharing platform.

Methods

The data element dictionary of gastrointestinal tumor biobank information sharing platform was established preliminarily based on literature retrieval and expert consultation. Then two rounds of questionnaire survey among twenty-four experts were carried out using Delphi method by Emails.

Results

In the two rounds of expert consultation, the positive coefficients were 100.00% and 91.67%, the authority coefficients were 0.825 and 0.832, the coordination coefficients were 0.434 and 0.467 respectively (all P<0.001). The framework included 4 first-level dierctories, 11 second-level dierctories and 49 third-level dierctories.

Conclusion

The classification framework of data element dictionary of gastrointestinal tumor biobank information sharing platform constructed by Delphi method is scientific and reliable, which can promote the establishment of network sharing platform and realize the retrieval and sharing of gastrointestinal tumor biosample information.

Key words: Delphi method, Biobank, Sharing platform, Data element directory

表1 两轮专家咨询各指标重要性平均值和变异系数范围

轮次	一级条目		二级条目		三级条目
轮次	重要性平均值	变异系数	重要性平均值	变异系数	重要性平均值	变异系数
1	4.29~4.92	0.06~0.15	3.50~4.96	0.04~0.22	3.25~5.00	0~0.30
2	4.23~4.96	0.04~0.15	3.55~4.96	0.04~0.23	3.36~5.00	0~0.24

表1 两轮专家咨询各指标重要性平均值和变异系数范围

轮次	一级条目		二级条目		三级条目
轮次	重要性平均值	变异系数	重要性平均值	变异系数	重要性平均值	变异系数
1	4.29~4.92	0.06~0.15	3.50~4.96	0.04~0.22	3.25~5.00	0~0.30
2	4.23~4.96	0.04~0.15	3.55~4.96	0.04~0.23	3.36~5.00	0~0.24

表2 第二轮咨询结果各级条目的重要性和变异系数

条目			重要性()	变异系数	条目			重要性()	变异系数
A.样本信息			4.96±0.21	0.04			B2-5.验血指标	4.59±0.59	0.13
	A1.样本实体信息		4.96±0.21	0.04			B2-6.病理诊断	4.91±0.29	0.06
		A1-1.样本编码	5.00±0.00	0.00			B2-7.影像资料	4.64±0.49	0.11
		A1-2.样本类型	4.96±0.21	0.04			B2-8.内镜资料	4.50±0.67	0.15
		A1-3.入库日期	4.77±0.53	0.11			B2-9.临床诊断	4.77±0.43	0.09
		A1-4.保存温度	4.96±0.21	0.04		B3.治疗相关信息		4.73±0.46	0.10
		A1-5.分管数	4.50±0.74	0.16			B3-1.手术方式	4.59±0.67	0.15
		A1-6.样本量	4.27±0.83	0.19			B3-2.放疗情况	4.68±0.57	0.12
		A1-7.量单位	4.14±0.83	0.20			B3-3.化疗情况	4.68±0.57	0.12
		A1-8.知情同意	4.91±0.29	0.06			B3-4.靶向治疗	4.68±0.57	0.12
	A2.样本采集信息		4.86±0.35	0.07			B3-5.免疫治疗	4.64±0.58	0.13
		A2-1.采集部位	4.86±0.35	0.07		B4.随访情况		4.82±0.39	0.08
		A2-2.采集时间	4.77±0.43	0.09			B4-1.随访记录	4.86±0.35	0.07
		A2-3.采集机构	4.68±0.57	0.12		B5.临床试验情况		3.91±0.68	0.17
	A3.样本运输信息		4.59±0.59	0.13			B5-1.临床试验	4.05±0.72	0.18
		A3-1.运输方式	4.46±0.60	0.13	C.样本保存机构			4.50±0.67	0.15
		A3-2.接收时间	4.36±0.66	0.15		C1.保存机构信息		4.09±0.68	0.17
	A4.样本处理信息		4.73±0.46	0.10			C1-1.保存机构名称	3.82±0.66	0.17
		A4-1.处理方式	4.59±0.50	0.11			C1-2.使用许可	4.09±0.61	0.15
		A4-2.处理时间	4.46±0.60	0.13			C1-3.通信地址	3.68±0.65	0.18
B.样本源信息			4.86±0.35	0.07			C1-4.管理员姓名	3.55±0.74	0.21
	B1.捐献者基本信息		4.64±0.66	0.14			C1-5.联系电话	3.86±0.64	0.17
		B1-1.捐献者匿名编号	4.27±0.70	0.16			C1-6.联系邮箱	3.77±0.69	0.18
		B1-2.性别	4.82±0.39	0.08	D.样本出库申请			4.23±0.61	0.14
		B1-3.年龄	4.86±0.35	0.07		D1.研究课题组信息		3.55±0.80	0.23
		B1-4.民族	4.77±0.43	0.09			D1-1.所属机构	3.73±0.70	0.19
		B1-5.籍贯	4.32±0.57	0.13			D1-2.课题名称	3.68±0.89	0.24
	B2.诊断相关信息		4.82±0.39	0.08			D1-3.课题编号	3.68±0.89	0.24
		B2-1.现病史	4.82±0.39	0.08			D1-4.是否通过伦理审查	4.77±0.43	0.09
		B2-2.既往史	4.50±0.51	0.11			D1-5.申请人姓名	3.73±0.88	0.24
		B2-3.个人史	4.46±0.51	0.11			D1-6.申请人电话	3.77±0.87	0.23
		B2-4.家族史	4.59±0.50	0.11			D1-7.申请人邮箱	3.77±0.87	0.23

表2 第二轮咨询结果各级条目的重要性和变异系数

条目			重要性()	变异系数	条目			重要性()	变异系数
A.样本信息			4.96±0.21	0.04			B2-5.验血指标	4.59±0.59	0.13
	A1.样本实体信息		4.96±0.21	0.04			B2-6.病理诊断	4.91±0.29	0.06
		A1-1.样本编码	5.00±0.00	0.00			B2-7.影像资料	4.64±0.49	0.11
		A1-2.样本类型	4.96±0.21	0.04			B2-8.内镜资料	4.50±0.67	0.15
		A1-3.入库日期	4.77±0.53	0.11			B2-9.临床诊断	4.77±0.43	0.09
		A1-4.保存温度	4.96±0.21	0.04		B3.治疗相关信息		4.73±0.46	0.10
		A1-5.分管数	4.50±0.74	0.16			B3-1.手术方式	4.59±0.67	0.15
		A1-6.样本量	4.27±0.83	0.19			B3-2.放疗情况	4.68±0.57	0.12
		A1-7.量单位	4.14±0.83	0.20			B3-3.化疗情况	4.68±0.57	0.12
		A1-8.知情同意	4.91±0.29	0.06			B3-4.靶向治疗	4.68±0.57	0.12
	A2.样本采集信息		4.86±0.35	0.07			B3-5.免疫治疗	4.64±0.58	0.13
		A2-1.采集部位	4.86±0.35	0.07		B4.随访情况		4.82±0.39	0.08
		A2-2.采集时间	4.77±0.43	0.09			B4-1.随访记录	4.86±0.35	0.07
		A2-3.采集机构	4.68±0.57	0.12		B5.临床试验情况		3.91±0.68	0.17
	A3.样本运输信息		4.59±0.59	0.13			B5-1.临床试验	4.05±0.72	0.18
		A3-1.运输方式	4.46±0.60	0.13	C.样本保存机构			4.50±0.67	0.15
		A3-2.接收时间	4.36±0.66	0.15		C1.保存机构信息		4.09±0.68	0.17
	A4.样本处理信息		4.73±0.46	0.10			C1-1.保存机构名称	3.82±0.66	0.17
		A4-1.处理方式	4.59±0.50	0.11			C1-2.使用许可	4.09±0.61	0.15
		A4-2.处理时间	4.46±0.60	0.13			C1-3.通信地址	3.68±0.65	0.18
B.样本源信息			4.86±0.35	0.07			C1-4.管理员姓名	3.55±0.74	0.21
	B1.捐献者基本信息		4.64±0.66	0.14			C1-5.联系电话	3.86±0.64	0.17
		B1-1.捐献者匿名编号	4.27±0.70	0.16			C1-6.联系邮箱	3.77±0.69	0.18
		B1-2.性别	4.82±0.39	0.08	D.样本出库申请			4.23±0.61	0.14
		B1-3.年龄	4.86±0.35	0.07		D1.研究课题组信息		3.55±0.80	0.23
		B1-4.民族	4.77±0.43	0.09			D1-1.所属机构	3.73±0.70	0.19
		B1-5.籍贯	4.32±0.57	0.13			D1-2.课题名称	3.68±0.89	0.24
	B2.诊断相关信息		4.82±0.39	0.08			D1-3.课题编号	3.68±0.89	0.24
		B2-1.现病史	4.82±0.39	0.08			D1-4.是否通过伦理审查	4.77±0.43	0.09
		B2-2.既往史	4.50±0.51	0.11			D1-5.申请人姓名	3.73±0.88	0.24
		B2-3.个人史	4.46±0.51	0.11			D1-6.申请人电话	3.77±0.87	0.23
		B2-4.家族史	4.59±0.50	0.11			D1-7.申请人邮箱	3.77±0.87	0.23

[1]	袁姣，任虹，吴建才, 等. 我国生物样本库建设现状与对策[J]. 转化医学杂志, 2020, 9(3): 129-132.
[2]	张黎黎，胡建平，徐勇勇. 临床数据传输数据组和数据元标准的研究[J]. 中国卫生信息管理杂志, 2019, 16(1): 77-83.
[3]	蒋雪莉，李慧，柳菁菁, 等.恶性肿瘤生物样本信息数据库的构建及应用[J/CD]. 中华临床实验室管理电子杂志, 2019, 7(3): 184-189.
[4]	Hofer-Picout P, Pichler H, Eder J, et al. Conception and implementation of an Austrian biobank directory integration framework[J]. Biopreserv Biobank, 2017, 15(4): 332-340.
[5]	王博，刘芳，张二春, 等. 国家基因库：共有、共为、共享[J]. 遗传, 2019, 41(8): 761-772.
[6]	李天君，汪德海，于磊, 等. 基于ISO 20387: 2018标准生物样本库文件构建[J]. 转化医学杂志, 2020, 9(3): 133-136.
[7]	郭义雄，张妍乐，李唯, 等. 多中心生物样本库信息管理系统建设的探索[J/CD]. 中西医结合心血管病电子杂志, 2019, 7(13): 26-28.
[8]	Mellett C, O’ Donovan A, Hayes C. The development of outcome key performance indicators for systemic anti-cancer therapy using a modified Delphi method[J]. Eur J Cancer Care, 2020, 294(4): e13240.
[9]	徐倩，熊振芳，万长秀, 等. 护理管理信息数据元目录分类框架体系的构建[J]. 护理学杂志, 2017, 32(23): 53-56.
[10]	柯思思，朱朝阳，张刚, 等. 应用德尔菲法构建医院突发公共卫生事件应对能力[J]. 中国社会医学杂志, 2019, 36(6): 643-646.
[11]	曾光. 现代流行病学方法与应用[M]. 北京：北京医科大学协和医科大学联合出版社, 1996: 257-259.
[12]	Merino-Martinez R, Norlin L, van Enckevort D, et al. Toward global biobank integration by implementation of the minimum information about BIobank Data Sharing (MIABIS 2.0 Core)[J]. Biopreserv Biobank, 2016, 14(4): 298-306.
[13]	Lehmann S, Guadagni F, Moore H, et al. Standard preanalytical coding for biospecimens: review and implementation of the Sample PREanalytical Code (SPREC)[J]. Biopreserv Biobank, 2012, 10(4): 366-374.
[14]	郜恒郡. 中国生物样本库-理论与实践[M]. 北京：科学出版社, 2017: 172.
[15]	丘宇茹，王吉文，吴惠文. 应用德尔菲法构建综合医院急诊查对制度[J]. 中国临床护理, 2020, 12(2): 102-106.
[16]	Niederberger M, Spranger J. Delphi technique in health sciences: A map[J]. Front Public Health, 2020, 8: 457.
[17]	单芳，桑爱民，薛琴, 等. 生物样本库研究的隐私保护问题及伦理反思[J]. 中国卫生事业管理, 2020, 37(1): 43-46.

[1]	王丽萍, 吕芳, 李雪丽, 潘宇, 吕晓芹, 何笑, 王力, 张晓梅. 多囊卵巢综合征患者卵泡液长链非编码RNA基因表达谱研究[J]. 中华妇幼临床医学杂志(电子版), 2018, 14(01): 77-84.
[2]	陈晓曼, 张海波, 薛曼婕, 魏波, 邵军, 韩晓燕. -80℃低温保藏对结直肠癌血浆miRNA标志物的影响[J]. 中华普通外科学文献(电子版), 2023, 17(01): 24-27.
[3]	余其澳, 宋欢, 汪晓东, 李立. 英国生物样本库（UK Biobank）在结直肠癌临床研究中的应用[J]. 中华结直肠疾病电子杂志, 2021, 10(04): 351-356.
[4]	王一, 吴小倩, 黄伟芳, 裴斌, 尚芳, 孔德松, 王小峰, 朱勇, 姚航, 刘飞, 樊志敏. 结直肠癌类器官生物样本库的建立和应用研究进展[J]. 中华结直肠疾病电子杂志, 2021, 10(03): 302-305.
[5]	于洋, 王贵玉. 标准化结直肠肿瘤生物样本库的建立、管理及质量控制的经验探讨[J]. 中华结直肠疾病电子杂志, 2018, 07(02): 167-171.
[6]	中国医师协会重症医学医师分会神经重症专业委员会, 国家神经系统疾病医疗质量控制中心神经重症委员会. 神经重症医师核心知识和能力：基于德尔菲法及名义小组法的中国专家共识[J]. 中华重症医学电子杂志, 2023, 09(01): 1-8.
[7]	王国文, 傅昌, 李珍, 史秀欣, 成海燕, 范俊杰, 李超凡, 王强. 基层医疗卫生机构突发公共卫生事件应急能力评价指标体系构建[J]. 中华临床医师杂志(电子版), 2022, 16(10): 1019-1023.
[8]	周世一, 程雅婷, 江真君, 文国学, 刘勇. 基于开源生物样本库信息管理平台的网络化建设[J]. 中华临床实验室管理电子杂志, 2020, 08(01): 48-53.
[9]	蒋雪莉, 李慧, 柳菁菁, 张琳娜, 李文秀, 姚洁, 程颖. 恶性肿瘤生物样本信息数据库的构建及应用[J]. 中华临床实验室管理电子杂志, 2019, 07(03): 184-189.
[10]	王丽萍, 居益君, 唐万, 崔有文, 毛睿, 鲁军, 金鑫, 潘云龙. 运用PDCA循环　强化生物样本库信息管理的探讨[J]. 中华临床实验室管理电子杂志, 2017, 05(04): 232-235.
[11]	戴涵清, 俞磊, 李艺, 陆胜, 职庭帆, 杨光, 周学迅, 王雪琦. 自动化存储管理系统在生物样本库领域的应用及展望[J]. 中华临床实验室管理电子杂志, 2017, 05(01): 46-50.
[12]	江碧艳, 刘彩霞, 杨舒岚, 楼巍敏, 陈凌燕, 陈春英. 痴呆老年人团体活动实施方案的构建[J]. 中华老年病研究电子杂志, 2023, 10(02): 37-43.
[13]	杨舒岚, 江碧艳, 叶蕾, 金肖青, 王钧正, 黄金月, 刘彩霞. 老年人内在能力综合评价指标体系的构建[J]. 中华老年病研究电子杂志, 2023, 10(01): 41-47.
[14]	管惠兰, 陈凌燕, 张靖梅, 沈珊珊, 江碧艳, 杨舒岚. 老年综合评估护士核心胜任力评价体系的构建[J]. 中华老年病研究电子杂志, 2022, 09(04): 46-51.
[15]	管惠兰, 杨舒岚, 陈凌燕, 方娟, 张靖梅, 徐赛珠, 陈文英. 老年护理专科护士专科理论核心内容的构建[J]. 中华老年病研究电子杂志, 2022, 09(01): 45-51.

阅读次数

全文

摘要

选择文件类型/文献管理软件名称

选择包含的内容

Construction of a classification framework of data element dictionary of gastrointestinal tumor biobank

模态框（Modal）标题

选择文件类型/文献管理软件名称

选择包含的内容

Construction of a classification framework of data element dictionary of gastrointestinal tumor biobank