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中华普通外科学文献(电子版)

中华普通外科学文献(电子版) ›› 2021, Vol. 15 ›› Issue (02) : 125 -130. doi: 10.3877/cma.j.issn.1674-0793.2021.02.010

所属专题： 文献；

论著

24个单核苷酸多态性位点与皖北地区布加综合征相关性研究
崔建伟1, 高涌1, 余朝文1, 刘亚1, 赵新宇1, 陈世远1,†()   
  1. 1. 233004　蚌埠医学院第一附属医院血管外科
  • 收稿日期:2020-11-04 出版日期:2021-04-01
  • 通信作者: 陈世远
  • 基金资助:
    安徽省科技厅科技攻关计划资助项目(1704a080 2160); 蚌埠医学院2019年研究生创新计划项目(Byycx1969)

Study on the relationship between 24 single nucleotide polymorphisms and Budd-Chiari syndrome in northern Anhui province

Jianwei Cui1, Yong Gao1, Chaowen Yu1, Ya Liu1, Xinyu Zhao1, Shiyuan Chen1,†()   

  1. 1. Department of Vascular Surgery, the First Affiliated Hospital of Bengbu Medical College, Bengbu 233004, China
  • Received:2020-11-04 Published:2021-04-01
  • Corresponding author: Shiyuan Chen
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引用本文：

崔建伟, 高涌, 余朝文, 刘亚, 赵新宇, 陈世远. 24个单核苷酸多态性位点与皖北地区布加综合征相关性研究[J/OL]. 中华普通外科学文献(电子版), 2021, 15(02): 125-130.

Jianwei Cui, Yong Gao, Chaowen Yu, Ya Liu, Xinyu Zhao, Shiyuan Chen. Study on the relationship between 24 single nucleotide polymorphisms and Budd-Chiari syndrome in northern Anhui province[J/OL]. Chinese Archives of General Surgery(Electronic Edition), 2021, 15(02): 125-130.

目的

探讨24个相关基因单核苷酸多态性（SNPs）位点与皖北地区布加综合征（BCS）的关系，为BCS的诊断和针对性治疗提供新依据。

方法

选取2017年2月至2019年6月蚌埠医学院第一附属医院收治的80例BCS患者（BCS组），另选取同期80例健康体检者（对照组），静脉血提取DNA，应用Agena MassARRAY SNP结合多重PCR技术、MassARRAY iPLEX单碱基延伸技术和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）技术通过检测延伸产物相对分子量对21个基因中24个SNPs进行分型检测，分析各基因型、等位基因的差异表达。

结果

其中6个SNPs位点统计结果不符合Hardy-Weinberg平衡；18个SNPs位点基因型频率分布在BCS组及对照组间差异无统计学意义。BCS组MTHFR C677T（rs1801133）基因位点A等位基因频率高于对照组（OR=2.769，95% CI：1.171~4.465，P=0.004）。

结论

MTHFR C677T（rs1801133）基因位点A等位基因可能是皖北地区BCS的危险因素。

关键词: 多态性, 单核苷酸, 亚甲基四氢叶酸还原酶, 布加综合征
Objective

To explore the relationship between 24 related gene single nucleotide polymorphisms (SNPs) and Budd-Chiari syndrome (BCS) in northern Anhui Province, and to provide a new basis for BCS genetic diagnosis and targeted treatment.

Methods

80 patients with Budd-Chiari syndrome (BCS group) and 80 healthy controls (control group) were selected from the First Affiliated Hospital of Bengbu Medical College from February 2017 to June 2019. Venous blood was taken to extract DNA. Agena MassARRAY SNP combined with multiplex PCR technology, MassARRAY iPLEX single base extension technology and matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry mass spectrometry technology were used to detect the 24 SNPs in 21 genes by detecting the molecular weight of extension products, and analyze the differential expression of each genotype and allele in each group.

Results

The statistical results of 6 SNP loci did not meet the Hardy-Weinberg equilibrium. The genotype frequency distribution of 18 SNP loci was not statistically different between the BCS group and the control group. The frequency of MTHFR C677T (rs1801133) locus A allele frequency in the BCS group was higher than that in the control group (OR=2.769, 95% CI: 1.171-4.465, P=0.004).

Conclusion

The MTHFR C677T (rs1801133) locus A allele may be a risk factor for BCS in northern Anhui.

Key words: Polymorphism, single nucleotide, Methylenetetraoxyfolate reductase, Budd-Chiari syndrome
表1 扩增及延伸引物序列
基因位点 扩增引物第一序列 扩增引物第二序列 延伸引物序列
rs1981316 ACGTTGGATGACAGTATTTTGTGGAAGCCC ACGTTGGATGAGAAAAGCCACAAGCACAAC AAGCACAACGTGCTC
rs429358 ACGTTGGATGTGCACCTCGCCGCGGTACT ACGTTGGATGCTGTCCAAGGAGCTGCAGG GACATGGAGGACGTG
rs9515162 ACGTTGGATGACATTCCACCATTGCCTCAC ACGTTGGATGAAGCCAAGCAACTCCATGTC CATGTCACATGGGTCA
rs6046 ACGTTGGATGTGACGATGCCCGTCAGGTA ACGTTGGATGTACTCGGATGGCAGCAAGGA gCATGCCACCCACTACC
rs1801133 ACGTTGGATGCACTTGAAGGAGAAGGTGTC ACGTTGGATGGTGCATGCCTTCACAAAGCG GCGTGATGATGAAATCG
rs1800790 ACGTTGGATGCAAAAGATAAACACATTATG ACGTTGGATGGCTTATGTTTTCTGACAATG TTCTATTTCAAAAGGGGC
rs1042579 ACGTTGGATGGGTACCTTCGAGTGCATCTG ACGTTGGATGAGTCACAGTCGGTGCCAATG aaGGTGCCAATGTGGCGG
rs3783113 ACGTTGGATGACAGACCTTCTGTTCAGGAC ACGTTGGATGGTGGTGTGTTGTACGAAGAC CAAACTTCCTTACACAACA
rs16876325 ACGTTGGATGAAGTGCCAAAAACTTCTGTC ACGTTGGATGGTGATGATGCTTTCAGCGTG cGCAGGTCAAGTCTGCCAA
rs199469469 ACGTTGGATGTCTGTGTCTCGTTTCAGGTG ACGTTGGATGTCAGTGAAGTTCCCTTGTGG acGGAAGCGGATGGAGAAG
rs1805087 ACGTTGGATGCTTTGAGGAAATCATGGAAG ACGTTGGATGTACCACTTACCTTGAGAGAC CCTTGAGAGACTCATAATGG
rs6123 ACGTTGGATGGGATGAAGCCATTTCTAAAC ACGTTGGATGATAAGCAGAGAAAAGATGCC tTTTGTCTTTTTCCAAACTGA
rs662 ACGTTGGATGCCTGAGCACTTTTATGGCAC ACGTTGGATGACATACGACCACGCTAAACC ccaCAAATACATCTCCCAGGAT
rs867186 ACGTTGGATGAAACAAGCCGCTCCTACACT ACGTTGGATGTGCACAGGAAGATGCCTACA ggaaaACCAGCAATGATGAAAC
rs1801020 ACGTTGGATGAGTGTTGACTCCAAGCTCAC ACGTTGGATGTGATCTGGACTCCTGGATAG ggaAGCTGGACCAACGGACGGA
rs13306848 ACGTTGGATGTTCCTTTTCCCGAACGTCCA ACGTTGGATGGGCCAGGGCTCGAGTTTATA cccaGCTCGAGTTTATAAGTGCC
rs2020918 ACGTTGGATGTGAATAGGGCTTTGGCCGCT ACGTTGGATGCAGATAATTCCTTCTGACCC ccccCCATGGCTGTGTCTGGGGC
rs2854116 ACGTTGGATGGACTTGAGAACAAGTGGGTG ACGTTGGATGACTGATGCCTGGTCTTCTGT ccctaTGTGCCTTTACTCCAAACA
rs146922325 ACGTTGGATGTCAGTGAAGTTCCCTTGTGG ACGTTGGATGTCTGTGTCTCGTTTCAGGTG CGCTTCTTCTCCATCC
rs1799889 ACGTTGGATGCACAGAGAGAGTCTGGACAC ACGTTGGATGTCTTGGTCTTTCCCTCATCC ATGATACACGGCTGAC
rs7412 ACGTTGGATGACCTGCGCAAGCTGCGTAA ACGTTGGATGGCCCCGGCCTGGTACACTG CTGGTACACTGCCAGGC
rs1801131 ACGTTGGATGCCGAGAGGTAAAGAACGAAG ACGTTGGATGTGAAGAGCAAGTCCCCCAAG GGAGCTGACCAGTGAAG
rs1126643 ACGTTGGATGAACATTGGCCTATTAGCACC ACGTTGGATGCCAGACATCCCAATATGGTG GGGACCTCACAAACACATT
rs4472483 ACGTTGGATGGGACACCAGGGAATAAATGC ACGTTGGATGTCCCAGGTCCATAAAGGATG TTGTACAGAAATCCCCAATCC
表2 不符合HWE平衡检验的6个基因位点
基因位点 基因型 观察值 期望值 χ2值 P值
THBD （rs13306848） AA:AG:GG 11:22:47 6.05:31.9:42.05 7.705 0.005
PROC C.574_576delAAG（rs146922325） CC:CT:TT 9:18:53 4.05:27.9:48.05 10.071 0.001
PAI-1 4G/5G（rs1799889） 4G4G:4G5G:5G5G 22:24:34 14.45:39.1:26.45 11.933 0.005
PROC Argl89Trp（rs199469469） DD:PD:PP 44:24:12 39.2:33.6:7.2 6.531 0.011
APOE E4（rs429358） CC:CT:TT 17:24:39 10.51:36.98:35.51 9.851 0.001
FV Arg353Gln（rs6046） AA:AG:GG 9:23:48 5.25:30.49:44.25 4.833 0.027
表3 18个SNP位点基因型及等位基因频率在BCS组和对照组中的分布
基因位点 组别 基因型[n(%)] 等位基因[n(%)] P1 P2 OR 95% CI
THBD   AA AG GG A G        
rs1042579 BCS组 12(15.0) 28(35.0) 40(50.0) 52(32.5) 108(67.5) 0.476 1.108 0.781 0.494~1.237
对照组 18(22.5) 25(31.3) 37(46.3) 61(38.1) 99(61.9)        
GPIaITGA2   CC CT TT C T        
rs1126643 BCS组 44(55.0) 28(35.0) 8(10.0) 116(72.5) 44(27.5) 0.149 0.065 1.618 0.996~2.628
对照组 32(45.1) 24(33.8) 15(21.1) 88(62.0) 54(38.0)        
ANGPT1   GG GT TT G T        
rs16876325 BCS组 54(67.5) 17(21.3) 9(11.3) 125(78.1) 35(21.9) 0.091 0.079 0.569 0.317~1.023
对照组 60(75.0) 18(22.5) 2(2.5) 138(86.3) 22(13.8)        
FGB   AA AG GG A G        
rs1800790 BCS组 4(5.6) 52(72.2) 16(22.2) 60(41.7) 84(58.3) 0.057 0.558 1.154 0.715~1.863
对照组 8(11.8) 36(52.9) 24(35.3) 52(38.2) 84(61.8)        
FXⅡ   AA AG GG A G        
rs1801020 BCS组 48(63.2) 20(26.3) 8(10.5) 116(76.3) 36(23.7) 0.089 0.897 1.036 0.610~1.759
对照组 40(52.6) 32(42.1) 4(5.3) 112(75.7) 36(24.3)        
MTHFR   GG GT TT G T        
rs1801131 BCS组 8(10.0) 60(75.0) 12(15.0) 76(47.5) 84(52.5) 0.069 0.086 1.478 0.945~2.310
对照组 4(5.1) 52(65.8) 23(29.1) 60(38.0) 98(62.0)        
MTHFR   AA AG GG A G        
rs1801133 BCS组 28(36.8) 40(52.6) 8(10.5) 96(63.2) 56(36.8) 0.122 0.004 2.769 1.171~4.465
对照组 17(22.1) 48(62.3) 12(15.6) 52(38.2) 84(61.8)        
MTR   AA AG GG A G        
rs1805087 BCS组 52(68.4) 20(26.3) 4(5.3) 124(81.6) 28(18.4) 0.258 0.127 1.527 0.885~2.634
对照组 48(61.5) 20(25.6) 4(12.8) 116(74.4) 40(25.6)        
COL4A1   AA AC CC A C        
rs1981316 BCS组 8(10.0) 44(55.0) 28(35.0) 60(37.5) 100(62.5) 0.141 0.272 1.296 0.815~2.060
对照组 2(2.5) 46(57.5) 32(40) 50(31.6) 108(68.4)        
tPA   AA AG GG A G        
rs2020918 BCS组 4(5.3) 36(47.4) 36(47.4) 44(28.9) 108(71.1) 0.100 0.114 0.660 0.409~1.067
对照组 12(15.8) 34(44.7) 30(39.5) 58(38.2) 94(61.8)        
APOC3   CC CT TT C T        
rs2854116 BCS组 12(15.4) 56(71.8) 10(12.8) 80(51.3) 76(48.7) 0.091 0.828 0.952 0.613~1.481
对照组 20(25.0) 44(55.0) 16(20.0) 84(52.5) 76(47.5)        
COL4A1   CC CT TT C T        
rs3783113 BCS组 28(36.8) 12(15.8) 36(47.4) 68(44.7) 84(55.3) 0.131 0.372 0.810 0.509~1.287
对照组 32(47.1) 4(5.9) 32(47.1) 68(50.0) 68(50.0)        
ANGPT1   GG GT TT G T        
rs4472483 BCS组 16(21.1) 48(63.2) 12(15.8) 80(52.6) 72(47.4) 0.176 0.424 1.200 0.767~1.877
对照组 18(23.1) 39(50.0) 21(26.9) 75(48.1) 81(51.9)        
PROS1   CC CT TT C T        
rs6123 BCS组 16(20.5) 28(35.9) 34(43.6) 60(38.5) 96(61.5) 0.188 0.396 0.820 0.519~1.297
对照组 23(31.1) 18(24.3) 33(44.6) 64(43.2) 84(56.8)        
PON1   CC CT TT C T        
rs662 BCS组 20(25.6) 36(46.2) 22(28.2) 76(48.7) 80(51.3) 0.301 0.250 0.769 0.491~1.204
对照组 28(36.8) 28(36.8) 20(26.3) 84(55.3) 68(44.7)        
EAPOE   CC CT TT C T        
rs7412 BCS组 68(87.2) 6(7.7) 4(5.1) 142(91.0) 14(9.0) 0.205 0.083 1.902 0.904~3.834
对照组 58(76.3) 12(15.8) 6(7.9) 128(84.2) 24(15.8)        
PROCR   AA AG GG A G        
rs867186 BCS组 72(92.3) 4(5.1) 2(2.6) 148(94.9) 8(5.1) 0.412 0.607 1.285 0.493~3.347
对照组 68(88.3) 8(10.4) 1(1.3) 144(93.5) 10(6.5)        
COL4A1   CC CT TT C T        
rs9515162 BCS组 46(60.5) 22(28.9) 8(10.5) 114(75.0) 38(25.0) 0.396 0.687 0.897 0.530~1.520
对照组 45(59.2) 27(35.5) 4(5.3) 117(77.0) 35(23.0)        
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