Construction of a classification framework of data element dictionary of gastrointestinal tumor biobank

doi:10.3877/cma.j.issn.1674-0793.2022.01.006

Abstract

Abstract:

Objective

To construct a classification framework of data element dictionary of gastrointestinal tumor biobank information sharing platform.

Methods

The data element dictionary of gastrointestinal tumor biobank information sharing platform was established preliminarily based on literature retrieval and expert consultation. Then two rounds of questionnaire survey among twenty-four experts were carried out using Delphi method by Emails.

Results

In the two rounds of expert consultation, the positive coefficients were 100.00% and 91.67%, the authority coefficients were 0.825 and 0.832, the coordination coefficients were 0.434 and 0.467 respectively (all P<0.001). The framework included 4 first-level dierctories, 11 second-level dierctories and 49 third-level dierctories.

Conclusion

The classification framework of data element dictionary of gastrointestinal tumor biobank information sharing platform constructed by Delphi method is scientific and reliable, which can promote the establishment of network sharing platform and realize the retrieval and sharing of gastrointestinal tumor biosample information.

Key words: Delphi method, Biobank, Sharing platform, Data element directory

Manjie Xue, Bo Wei, Sile Chen, Lang Xie, Niu Zou, Hongbo Wei, Xiaoyan Han. Construction of a classification framework of data element dictionary of gastrointestinal tumor biobank[J]. Chinese Archives of General Surgery(Electronic Edition), 2022, 16(01): 32-36.

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Figures/Tables 2

References 17

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轮次	一级条目		二级条目		三级条目
轮次	重要性平均值	变异系数	重要性平均值	变异系数	重要性平均值	变异系数
1	4.29~4.92	0.06~0.15	3.50~4.96	0.04~0.22	3.25~5.00	0~0.30
2	4.23~4.96	0.04~0.15	3.55~4.96	0.04~0.23	3.36~5.00	0~0.24

轮次	一级条目		二级条目		三级条目
轮次	重要性平均值	变异系数	重要性平均值	变异系数	重要性平均值	变异系数
1	4.29~4.92	0.06~0.15	3.50~4.96	0.04~0.22	3.25~5.00	0~0.30
2	4.23~4.96	0.04~0.15	3.55~4.96	0.04~0.23	3.36~5.00	0~0.24

条目			重要性()	变异系数	条目			重要性()	变异系数
A.样本信息			4.96±0.21	0.04			B2-5.验血指标	4.59±0.59	0.13
	A1.样本实体信息		4.96±0.21	0.04			B2-6.病理诊断	4.91±0.29	0.06
		A1-1.样本编码	5.00±0.00	0.00			B2-7.影像资料	4.64±0.49	0.11
		A1-2.样本类型	4.96±0.21	0.04			B2-8.内镜资料	4.50±0.67	0.15
		A1-3.入库日期	4.77±0.53	0.11			B2-9.临床诊断	4.77±0.43	0.09
		A1-4.保存温度	4.96±0.21	0.04		B3.治疗相关信息		4.73±0.46	0.10
		A1-5.分管数	4.50±0.74	0.16			B3-1.手术方式	4.59±0.67	0.15
		A1-6.样本量	4.27±0.83	0.19			B3-2.放疗情况	4.68±0.57	0.12
		A1-7.量单位	4.14±0.83	0.20			B3-3.化疗情况	4.68±0.57	0.12
		A1-8.知情同意	4.91±0.29	0.06			B3-4.靶向治疗	4.68±0.57	0.12
	A2.样本采集信息		4.86±0.35	0.07			B3-5.免疫治疗	4.64±0.58	0.13
		A2-1.采集部位	4.86±0.35	0.07		B4.随访情况		4.82±0.39	0.08
		A2-2.采集时间	4.77±0.43	0.09			B4-1.随访记录	4.86±0.35	0.07
		A2-3.采集机构	4.68±0.57	0.12		B5.临床试验情况		3.91±0.68	0.17
	A3.样本运输信息		4.59±0.59	0.13			B5-1.临床试验	4.05±0.72	0.18
		A3-1.运输方式	4.46±0.60	0.13	C.样本保存机构			4.50±0.67	0.15
		A3-2.接收时间	4.36±0.66	0.15		C1.保存机构信息		4.09±0.68	0.17
	A4.样本处理信息		4.73±0.46	0.10			C1-1.保存机构名称	3.82±0.66	0.17
		A4-1.处理方式	4.59±0.50	0.11			C1-2.使用许可	4.09±0.61	0.15
		A4-2.处理时间	4.46±0.60	0.13			C1-3.通信地址	3.68±0.65	0.18
B.样本源信息			4.86±0.35	0.07			C1-4.管理员姓名	3.55±0.74	0.21
	B1.捐献者基本信息		4.64±0.66	0.14			C1-5.联系电话	3.86±0.64	0.17
		B1-1.捐献者匿名编号	4.27±0.70	0.16			C1-6.联系邮箱	3.77±0.69	0.18
		B1-2.性别	4.82±0.39	0.08	D.样本出库申请			4.23±0.61	0.14
		B1-3.年龄	4.86±0.35	0.07		D1.研究课题组信息		3.55±0.80	0.23
		B1-4.民族	4.77±0.43	0.09			D1-1.所属机构	3.73±0.70	0.19
		B1-5.籍贯	4.32±0.57	0.13			D1-2.课题名称	3.68±0.89	0.24
	B2.诊断相关信息		4.82±0.39	0.08			D1-3.课题编号	3.68±0.89	0.24
		B2-1.现病史	4.82±0.39	0.08			D1-4.是否通过伦理审查	4.77±0.43	0.09
		B2-2.既往史	4.50±0.51	0.11			D1-5.申请人姓名	3.73±0.88	0.24
		B2-3.个人史	4.46±0.51	0.11			D1-6.申请人电话	3.77±0.87	0.23
		B2-4.家族史	4.59±0.50	0.11			D1-7.申请人邮箱	3.77±0.87	0.23

条目			重要性()	变异系数	条目			重要性()	变异系数
A.样本信息			4.96±0.21	0.04			B2-5.验血指标	4.59±0.59	0.13
	A1.样本实体信息		4.96±0.21	0.04			B2-6.病理诊断	4.91±0.29	0.06
		A1-1.样本编码	5.00±0.00	0.00			B2-7.影像资料	4.64±0.49	0.11
		A1-2.样本类型	4.96±0.21	0.04			B2-8.内镜资料	4.50±0.67	0.15
		A1-3.入库日期	4.77±0.53	0.11			B2-9.临床诊断	4.77±0.43	0.09
		A1-4.保存温度	4.96±0.21	0.04		B3.治疗相关信息		4.73±0.46	0.10
		A1-5.分管数	4.50±0.74	0.16			B3-1.手术方式	4.59±0.67	0.15
		A1-6.样本量	4.27±0.83	0.19			B3-2.放疗情况	4.68±0.57	0.12
		A1-7.量单位	4.14±0.83	0.20			B3-3.化疗情况	4.68±0.57	0.12
		A1-8.知情同意	4.91±0.29	0.06			B3-4.靶向治疗	4.68±0.57	0.12
	A2.样本采集信息		4.86±0.35	0.07			B3-5.免疫治疗	4.64±0.58	0.13
		A2-1.采集部位	4.86±0.35	0.07		B4.随访情况		4.82±0.39	0.08
		A2-2.采集时间	4.77±0.43	0.09			B4-1.随访记录	4.86±0.35	0.07
		A2-3.采集机构	4.68±0.57	0.12		B5.临床试验情况		3.91±0.68	0.17
	A3.样本运输信息		4.59±0.59	0.13			B5-1.临床试验	4.05±0.72	0.18
		A3-1.运输方式	4.46±0.60	0.13	C.样本保存机构			4.50±0.67	0.15
		A3-2.接收时间	4.36±0.66	0.15		C1.保存机构信息		4.09±0.68	0.17
	A4.样本处理信息		4.73±0.46	0.10			C1-1.保存机构名称	3.82±0.66	0.17
		A4-1.处理方式	4.59±0.50	0.11			C1-2.使用许可	4.09±0.61	0.15
		A4-2.处理时间	4.46±0.60	0.13			C1-3.通信地址	3.68±0.65	0.18
B.样本源信息			4.86±0.35	0.07			C1-4.管理员姓名	3.55±0.74	0.21
	B1.捐献者基本信息		4.64±0.66	0.14			C1-5.联系电话	3.86±0.64	0.17
		B1-1.捐献者匿名编号	4.27±0.70	0.16			C1-6.联系邮箱	3.77±0.69	0.18
		B1-2.性别	4.82±0.39	0.08	D.样本出库申请			4.23±0.61	0.14
		B1-3.年龄	4.86±0.35	0.07		D1.研究课题组信息		3.55±0.80	0.23
		B1-4.民族	4.77±0.43	0.09			D1-1.所属机构	3.73±0.70	0.19
		B1-5.籍贯	4.32±0.57	0.13			D1-2.课题名称	3.68±0.89	0.24
	B2.诊断相关信息		4.82±0.39	0.08			D1-3.课题编号	3.68±0.89	0.24
		B2-1.现病史	4.82±0.39	0.08			D1-4.是否通过伦理审查	4.77±0.43	0.09
		B2-2.既往史	4.50±0.51	0.11			D1-5.申请人姓名	3.73±0.88	0.24
		B2-3.个人史	4.46±0.51	0.11			D1-6.申请人电话	3.77±0.87	0.23
		B2-4.家族史	4.59±0.50	0.11			D1-7.申请人邮箱	3.77±0.87	0.23

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